MaxQuant(蛋白質譜分析軟件)是針對化學研究專門研發(fā)的一款蛋白質譜分析軟件，具有操作簡單，功能齊全，界面精簡友好，性能穩(wěn)定強大的特點。它提供了原始數據、組特定參數、全局參數、性能和可視化、組態(tài)等應用功能，可用于LC-MS/MS質譜測序數據的標量及非標量蛋白數據庫搜索及分析，輔助用戶將質譜產生的文件轉換為相應的肽段和蛋白情況。

軟件特色

1、用于分析大型質譜數據集的定量蛋白質組學。
2、用于LC-MS/MS質譜測序數據的標量及非標量蛋白數據庫搜索及分析。
3、操作簡單，使用率高。
4、功能強大，中英結合。
5、支持多種定量標記技術及非標定量。

MaxQuant使用方法

1、打開MaxQuant軟件，啟動以后進入分析界面

2、分析的時候需要將原始數據打開，點擊load就可以進入數據查看界面

3、也可以選擇特定的生物實驗數據組合打開，選擇建立多個分析實驗組

4、可以在下方設置全局參數，這里有很多可以選擇的模式例如 MS/MS-TMS ，MS/MS-Unknown

5、點擊 MS/MS- TOF，可以在左邊找到很多編輯的項目

6、支持TOF MS / MS去異位耐受性、支持TOF MS / MS去偏差公差單位

7、也可以選擇數據可視化，將生物實驗的數據顯示在圖表

8、在工具界面上可以找到氨基酸信息

9、打開以后出現下列數據，可以在這里查看氨基酸的相關數據

軟件功能

用于分析大型質譜數據集的定量蛋白質組學軟件包，
用于LC-MS/MS質譜測序數據的標量及非標量蛋白數據庫搜索及分析，
針對高分辨率的MS數據，支持多種定量標記技術及非標定量。
支持原始數據、組特定參數、全局參數、性能、可視化、組態(tài)
也支持在軟件上查看 Six frame translation、氨基酸、UniProt sequence extraction